南昌运输职业技术学校设有基础医疗室，配备常用药品和急救设备，可处理轻微伤病。心理咨询室同样存在，配备专业心理教师，为学生提供心理疏导、情绪支持及学业、人际关系等咨询服务。两者均位于校内，具体位置可咨询校务处或学生服务中心。医疗室与心理咨询室的设立，体现了学校对师生身心健康的重视，为校园生活提供了必要的保障与支持。