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新干中等专业学校助学金的申请流程一般包括以下几个步骤：首先，学生需提交申请书及家庭经济情况证明；然后，学校会对提交的材料进行审核；审核通过后，学校将公示名单并上报教育部门；最后，教育部门核准后，将助学金发放至学生账户。

至于发放时间，一般来说，助学金的发放时间多数在每年的学期末或者开学初。具体发放时间可能会因学校及政策差异而有所变动，建议学生及时关注学校公告以获取最新信息。