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大余县职业中等专业学校毕业证书与普通高中毕业证书的效力并不完全相同。虽然职业中等专业学校也提供中等教育，但其教育和方向更偏向于职业技能培训。因此，职业中专的毕业证书在求职或继续深造时，可能更受到与专业技能相关行业的认可。而普通高中毕业证书则更广泛地作为进入大学的资格。具体情况还需根据用人单位或教育机构的具体要求来确定。