江西省井冈山应用科技学校前身为江西省吉安农业学校，创办于1951年10月，是一所全日制普通中等专业学校，现隶属于吉安职业技术学院。2004年4月经江西省人民政府批准，更名为江西省井冈山应用科技学校，2009年12月经市教育局批准，增挂吉安农业学校校牌，实行两块牌子一套班子。2014年12月，学校迁入吉安职业技术学院，校址位于吉安市中心城区吉安南大道南侧，校园占地面积1098亩，建筑面积39.8万平方米，环境优美，按照"山水校园、庐陵书院"规划建设。

2018年12月24日，学校通过"国家中等职业教育改革发展示范学校建设计划"验收。